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domingo, 8 de maio de 2016

A fundamental paper on GMO risk assessment – Um artigo fundamental para a avaliação de risco de OGMs

A critical point in regulating “new technologies” is the loss of focus on the product: many scientists, regulators and – as expected – the biotech opposition, insist in discussing and embedding the technology in the regulatory framework. Moreover, once the right focus is regained, we still have to keep clear in our minds that regulations should be rooted on risk assessment (not on risk perception). A fundamental paper has just been published in Nature Botechnology:

Conko G, Kershen DL, Miller H, Parrott WA, 2016. A risk-based approach to the regulation of genetically engineered organisms. Nature Biotechnology 34: 493–503 doi:10.1038/nbt.3568
I suggest you should take some time to read it. If you don´t have access to the full paper, just send a note  (andrade@ufpe.br).

Kindly
Paulo Paes de Andrade
Department of Genetics/ Federal University of Pernambuco RECIFE  Brazil



Um ponto crítico na regulação de novas tecnologias é a perda do foco, que deve ser no produto: muitos cientistas, reguladores e – como esperado – a oposição à biotecnologia insistem em discutir e ancorar a tecnologia no arcabouço regulatório. Além disso, mesmo quando o foco correto é recuperado, ainda precisamos manter claro em nossa mente que a regulação deve estar baseada na avaliação de risco e não na percepção dos riscos. Um artigo fundamental acaba de ser publicado na revista Nature Biotechnology:

Conko G, Kershen DL, Miller H, Parrott WA, 2016. A risk-based approach to the regulation of genetically engineered organisms. Nature Biotechnology 34: 493–503 doi:10.1038/nbt.3568
Eu sugiro fortemente que você reserve um tempo para ler o artigo. Se você não tiver acesso ao texto completo, basta me enviar uma mensagem (andrade@ufpe.br).

Gentilmente,
Paulo Paes de Andrade
Departamento de Genética/ UFPE – RECIFE, Brasil



segunda-feira, 1 de setembro de 2014

Audiência pública sobre o eucalipto transgênico da FuturaGene


Aspectos gerais da audiência pública

A CTNBio convocou uma audiência pública para ouvir as várias partes sobre a adoção comercial do eucalipto transgênico que produz mais massa em menos tempo, portanto mais celulose por hectare. Nesta audiência o que interessa à Comissão são os aspectos de risco biológico intrínsecos ao eucalipto transgênico, que possam ser trazidos pelos participantes à audiência. Não interessam as questões econômicas ligadas à produção de celulose e muitos outros aspectos sociais, que não são da alçada da CTNBio, e sim do CNBS.

Ainda assim, não é preciso ter uma bola de cristal para saber que os aspectos não diretamente associados aos novos riscos que o eucalipto transgênico poderia trazer serão um foco muito secundário da discussão. Ela vai orbitar sobre a questão do plantio de eucalipto e de seu fomento, caso estas variedades de eucaliptos se provem um sucesso. A discussão também vai pender para o geral, isto é, bater na tecla de que a aprovação de uma primeira árvore transgênica vai abrir espaço para a aprovação de todas as demais, procurando-se obscurecer o fato de que a avaliação de risco é feita caso a caso.

Por falar em avaliação de riso, como se pode resumi-la no caso deste eucalipto?

Avaliação de risco do eucalipto transgênico expressando dois novos genes

Um dos primeiros passos da avaliação de risco é a identificação dos alvos de proteção, isto é, dos organismos que desejamos proteger e que poderiam ser de alguma forma afetados diferentemente pela planta transgênica, quando comparada com a mesma variedade não transgênica.

Para que o avaliador não se debruce sobre a questão de proteção a uma infinidade de alvos, é importante entender a biologia da planta e o ambiente onde ela será liberada, além dos usos pretendidos. Com isso, muitas rotas a um possível dano ao alvo de proteção em análise são excluídas.

Por exemplo, se estamos preocupados com a transferência de transgenes para espécies silvestres e com o impacto que estes novos genes poderiam ter na biota brasileira, é importante saber se o eucalipto apresenta polinização cruzada com outras espécies do país, para identificar a partir de quais plantas um fluxo gênico poderia ocorrer para longe do controle do agricultor. No caso do eucalipto, não existem plantas nativas que cruzem com ele e, na verdade, nem sequer outras espécies importadas, exceto as próprias espécies de eucalipto, que formam em certas ocasiões híbridos interespecíficos. Assim, a variedade transgênica não teria, sob este ponto de vista, um impacto diferente da variedade convencional e jamais poderia transferir seus genes para espécies silvestres.

Poderíamos, num tour de force, encarar as espécies exóticas de eucalipto como alvos de proteção da agrobiodiversidade. Acontece que a maior parte das variedades de eucalipto é propagada de forma vegetativa, sendo essencialmente nulo o plantio de sementes colhidas de polinizações abertas. Assim, o impacto sobre as variedades cultivadas seria essencialmente nulo ou muito pequeno.

As plantações de eucalipto servem de abrigo para uma série de organismos e também em alguns poucos casos como alimento. Poder-se-ia imaginar o impacto deste novo eucalipto na biota, através da ingestão de partes da planta. Um exemplo paradigmático desta preocupação é o que envolve o ser humano como alvo de proteção, impactado pelo consumo do mel elaborado a partir de flores das plantas transgênicas. Vamos nos fixar neste exemplo, tanto porque tem sido uma preocupação expressa por alguns setores da sociedade, como pela sua generalidade quanto ao uso de rotas ao dano para avaliação do risco.

Para construirmos uma rota que leva da presença das proteínas ao dano à saúde, precisamos identificar quais as novas proteínas que são expressas na planta e em que quantidade aparecem nos vários tecidos. No caso do mel, interessa o pólen, que não é a matéria prima do mel, mas pode ser encontrado nele em pequenas quantidades.

Comecemos avaliando as novas proteínas, produtos de dois genes inseridos. Uma delas é uma 1,4-b endoglucanase (aqui batizada de Cel1), proveniente da Arabidopsis thaliana, talvez uma das plantas melhor estudadas no Mundo. Esta enzima é responsável, junto com muitas outras, pela elongação celular nas plantas, especialmente em tecidos jovens. A outra enzima é a bem conhecida neomicina fosfotransferase tipo II (NPTII), que confere resistência aos antibióticos do grupo dos aminoglicosídeos por um mecanismo muito bem entendido e longamente estudado.

Antes de nos aprofundar nas propriedades destas duas proteínas, vamos observar a tota ao dano construída para apoiar a classificação do risco que estas proteínas poderiam significar para a saúde do consumidor do mel. Outras rotas poderiam ser construídas para o mesmo fim, esta é a que nos parece mais completa e com bases mais fortes em ciência.




Figura 1. Rota ao dano ligando a presença de duas novas proteínas nos tecidos da planta de eucalipto GM e um dano (intoxicação ou alergia) à saúde humana derivado do consumo do mel.
A rota começa com uma primeira pergunta: estas duas proteínas estão presentes no pólen? Como dito acima, o mel não é feito de pólen, mas este aparece em pequenas quantidades no mel. A matéria prima do mel é o néctar, que não contém proteínas. A resposta a esta pergunta é: sim, o pólen contém as duas proteínas. Portanto, seguimos para a segunda pergunta, sabendo que P1=1 (Probabilidade 1= 1), isto é, em 100% dos casos o pólen conterá as proteínas.

A segunda pergunta é: o mel conterá quantidades apreciáveis desta proteína? Como já se sabe deste Paracelso, a dose faz o veneno. A simples presença de uma substância não implica que Lea será benéfica ou prejudicial ao organismo, pois a quantidade ingerida (ou injetada) é importantíssima. Qualquer substância será tóxica em grande quantidade, mesmo a água. Inversamente, o mais forte veneno não terá qualquer efeito no organismo se a dose for muito pequena. Não queremos aqui nos estender em questões de toxicologia, mas apenas alertar que é importante ter uma noção da quantidade de proteína que estará presente no mel.

Ora, o mel não é feito de pólen, mas de néctar. O pólen chega ao mel de várias formas, usualmente levado pelas próprias abelhas. Uma fração muito menor pode entrar na colmeia transportada pelo vento. O pólen que cai no néctar e é sugado pela abelha é rapidamente retirado do néctar e quando este é regurgitado, está essencialmente livre de pólen. Assim, as outras vias de “contaminação” por pólen (adesão no corpo sendo a mais importante) terminam por terem maior relevância. A concentração de pólen no mel depende da qualidade do pólen e pode variar de menos de uma centena de grãos de pólen por 10 g de mel (mel de boa qualidade) até mais de 1 milhão! (mel ruim).  Em todas as circunstâncias, contudo, a quantidade efetiva de pólen no mel é diminuta.

E qual é a quantidade das duas proteínas no pólen? Todos os resultados apontam para uma quantidade muito pequena, correspondente a poucas partes por milhão.  Assim, multiplicando a fração que representa o pólen no mel pela fração que representa as proteínas no pólen, chega-se a um número extremamente pequeno, indicando que a exposição de quem come mel a estas proteínas será muito pequena.  Então, a resposta à segunda pergunta (“Uma quantidade significativa destas proteínas pode ser encontrada no mel?”) é NÃO: a probabilidade de que uma quantidade relevante das duas proteínas esteja presente no mel é reduzida (P2 é muito pequena).

Na terceira etapa da via devemos nos perguntar se uma pessoa pode absorver significativas quantidades destas proteínas ingerindo mel. Ora, o mel é um alimento consumido sempre em pequenas quantidades, ainda que em alguns casos diariamente. Assim, só há uma remota possibilidade de que a ingestão destas proteínas se dê em quantidades relevantes, implicando que P3 é muito pequena.

Supondo que as proteínas, ainda que raramente, cheguem ao nosso organismo, devemos nos perguntar:  estas proteínas têm mostrado alguma toxicidade ou alergenicidade?  As duas proteínas são muito comuns na natureza e não há relatos de que sejam tóxicas nem alergênicas. Portanto, a probabilidade de que, repentinamente, elas se tornem perigosas ao nosso organismo, é muito reduzida (P4 é muito pequena). Alguns poderiam argumentar que a modificação genética do eucalipto pode ter, como consequência inesperada, a produção de novas proteínas, tóxicas, mas isso é muito improvável.

A possibilidade de que algum dano ocorra ao alvo de proteção é o produto de todas as possibilidades de cada passo. Ora, exceto o primeiro passo, cujo valor é 1,0, todos os outros têm um valor muito pequeno. O produto de três parcelas muito pequenas é muito pequeno. Assim, a probabilidade de que algum dano ocorra é muito reduzida.

E a classe (ou magnitude) do dano, como classificar? Mesmo que alguma intoxicação ocorra, é provável que ela seja muito leve. Se houver alergia, basta que se suspenda o uso do mel. Quantas pessoas serão acometidas? Provavelmente um número muito reduzido. Assim, o dano não se estende a uma população, nem é permanente ou de difícil mitigação. Em linguagem técnica chamamos este dano de menor.

A composição da probabilidade de dano e da magnitude do dano define o risco, como mostrado na figura abaixo:


Figura 2. Classificação do risco de que o consumo de mel de eucalipto GM cause danos à população. A probabilidade é estimada a partir da rota ao dano mostrada na figura 1.

Para cada perigo percebido pelo público ou pelo avaliador de risco é indispensável a construção de uma rota ao dano como a mostrada acima. O uso desta metodologia dá base científica à avaliação de risco e afasta os perigos que não têm uma base científica pela qual provocar dano, como é o caso do mel, analisado acima.

No caso do eucalipto que expressa a proteína Cel1 todas as rotas ao dano para todos os perigos analisados levaram á mesma conclusão: os novos riscos são insignificantes. A decisão da CTNBio está em sintonia com a avaliação de risco das demais agências governamentais que se debruçaram sobre este eucalipto ou sobre outro evento de eucalipto semelhante.

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Uma fonte importante de informações sobre o pólen no mel segue: http://www.scirpus.ca/cap/articles/paper017.htm



sexta-feira, 18 de julho de 2014

O perigo dos transgênicos: evidências e críticas a elas - lista de autores, seus trabalhos e revisões críticas.

Não costumo copiar e colar informações de outros blogs. Mas a lista abaixo é muito informativa: quem são alguns dos mais importantes opositores aos transgênicos, suas master pieces e as réplicas a elas (ou critical reviews).

A lista não é completa: faltam nomes como o Jack Heinemann, o Michael Antoniou, a Mae Wan Ho, a Angela Hilbeck e ao menos mais uma dezena de outros pesquisadores. Eles publicam aqui e acolá trabalhos que “mostram” problemas sérios com a segurança ambiental ou alimentar dos transgênicos ou ainda fazem revisões teóricas sobre avaliação de risco, onde concluem sobre a incapacidade dos atuais avaliadores em todo o Mundo.

Mesmo sem ser completa, a lista ajuda a quem tem curiosidade de saber (e ler) o que estes pesquisadores publicaram e porque tantos cientistas baixaram o sarrafo nos trabalhos. Uma análise crítica vai mostrar que em todos os casos há falhas graves na metodologia ou especulação criativa, ou ambas as coisas.


Literatura científica sobre OGMs
Contents
·         1 Críticos proeminentes dos OGM

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Prominent GMO Critics

Thomas Bohn (Bøhn)

Critical Reviews
·         Reddit discussion on the study

Judy A. Carman

Critical Reviews

Z El-Shamei

Critical Reviews
Editorials
Scholarly works
Other useful information
·         Marsland Press, publisher of the Journal of American Science, is listed on Beall's List of Predatory Publishers

Bill Freese

Counterpoints
Editorials
Scholarly works
Discussions
Other useful information
·         Biotechnology & Genetic Engineering Reviews (journal) appears defunct
·         The Center for Food Safety appears on Quackwatch's list of questionable associations

Dr. Don Huber

Critical Reviews

Samuel Leblanc & Aziz Aris
Critical Reviews

John Losey

Critical Reviews
Editorials
Regulatory issues
Scholarly works
Discussions

Manuela Malatesta

Critical Reviews
Editorials
·         Opinion article by Myles Power (Scroll down to see Malatesta discussion)
Scholarly works
Discussions

Arpad Pusztai

Critical Reviews
Editorials
·         Pusztai's flawed claims.
Scholarly works
Discussions

Stephanie Seneff
Critical Reviews

Gilles-Eric Seralini (Séralini)
Critical Reviews
Editorials
·         Wikipedia: The Seralini Affair
·         Cami Ryan: I smell a rat.
·         Skeptico:The Seralini Rule
·         Monsanto Comments
Official reports and scholarly works
·         RETRACTED: Long term toxicity of a Roundup herbicide and a Roundup-tolerant genetically modified maize Includes links to Letters to the Editor of Food and Chemical Toxicology on this study.
Discussions

Critical Reviews
Editorials
·         Séralini did it again!
Discussions
Other useful information
·         Hindawi Publishing, publisher of BioMed Research International, was listed on Beall's List of Predatory Publishers through 2012. It has since been removed, but continues to receive complaints. (Read comments.)

Critical Reviews
Editorials
·         Conclusions 1 and 4 read:
·         “1. The conclusions are solely based upon in vitro tests on non-validated, non-representative cellular models (in particular tumour or transformed cells) that are directly exposed to extremely high concentrations of substances under growing conditions that do not respect normal physiological conditions. [...]”
·         “4. The authors over-interpret their results in relation to potential consequences on human health, in particular on the basis of an unsubstantiated in vitro-in vivo extrapolation. [...] the concentrations used in these tests would imply a huge exposure to glyphosate to obtain such cytotoxic effects on humans.”
Discussions

Critical Reviews
Other useful information
·         Jeffrey Beall questions the peer-review process of the International Journal of Biological Sciences, but note that there is a discrepancy between the publisher listed there and the one on the journal's website.
Vandana Shiva
·         Vandana Shiva's official site
·         Vandana Shiva on Wikipedia
·         Vandana Shiva CV
Critical Reviews
Editorials
Long reports and scholarly works
Discussions
Other useful information

Sándor Spisák
Critical Reviews

Thierry Vrain
Thierry Vrain's CV
Two open letters by Thierry Vrain
No anti-GMO scholarly works known

Critical Reviews
Editorials
·         Vrain and Chopra CFI Handout
Scholarly works
Discussions
Other useful information
Information relating to major claims in Thierry Vrain's TEDx talk
·         On genetic pollution in humans, on allergies, and on other health issues: Links to various safety threads on GMO SkeptiForum Facebook
·         On corporate influence in research: List of studies with independent funding. By Anastasia Bodnar on Biofortified.
·         On "one gene, one protein": Comment by Ewan Ross on Biofortified.
·         On the safety of Roundup/glyphosate: GMO SkeptiForum discussion on Roundup's impact on human health on Facebook

·         See also Z El-Shamei
·         See also Bill Freese
·         See also Don Huber
·         See also Manuela Malatesta
·         See also Arpad Pusztai
·         See also Stephanie Seneff
·         See also Gilles-Eric Seralini

2. Other Scientific Literature on GMOs
·         Rothamsted GM Wheat Trial